The effect of DMSO on ITS2 amplification in the molecular identification of Anopheles farauti Laveran (Diptera: Culicidae), from a colony established in the laboratory
Unduhan
Identifikasi spesies sibling sangat penting untuk mempelajari epidemiologi malaria. Ciri morfologi secara umum digunakan dalam identifikasi spesies Anopheles, namun tidak sesuai ketika digunakan untuk spesies sibling dan spesies kriptik. Analisis dengan menggunakan PCR-RFLP dari ITS2 rDNA pada saat ini merupakan metode yang paling cocok dan sensitif untuk membedakan spesies Anopheles punctulatus group. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh konsentrasi DMSO terhadap amplifikasi ITS2 dalam mengidentifikasi An. farauti dari koloni di BATAN Jakarta dengan PCR-RFLP berdasarkan ITS2 rDNA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penambahan DMSO dengan konsentrasi 6% dan 7% menghasilkan produk amplifikasi ITS2 dengan ukuran 750 pb. DMSO dapat digunakan dalam PCR untuk mencegah terbentuknya struktur sekunder ketika mengamplifikasi template dengan kandungan GC yang tinggi. Identifikasi molekular An. farauti dengan menggunakan PCR-RFLP merupakan Anopheles farauti sensu stricto.
Unduhan
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
